Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3BQ7Z3V4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms