Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEM1Q6ZVN7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEM1Q6ZVN7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms