Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEND4Q6ZU67 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms