Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPGS1Q6ZTW0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPGS1Q6ZTW0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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