Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms