Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCLAT1Q6UWP7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms