Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASC1Q6TDU7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms