Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTR9Q6PD62 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms