Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRNIPQ6NTE8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms