Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF6Q6KF10 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms