Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPPQ6IPU0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms