Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB3L3Q68CJ9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3L3Q68CJ9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms