Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms