Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF20Q5VTR2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms