Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms