Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms