Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HP1BP3Q5SSJ5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms