Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD3Q5JV73 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms