Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms