Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKDCCQ504Y2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms