Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms