Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms