Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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