Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6V1FQ16864 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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