Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTN1Q16799 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms