Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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