Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA3Q16281 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA3Q16281 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA3Q16281 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA3Q16281 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA3Q16281 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA3Q16281 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA3Q16281 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA3Q16281 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA3Q16281 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA3Q16281 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA3Q16281 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA3Q16281 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA3Q16281 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA3Q16281 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA3Q16281 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA3Q16281 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA3Q16281 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA3Q16281 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA3Q16281 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA3Q16281 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA3Q16281 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA3Q16281 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA3Q16281 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA3Q16281 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA3Q16281 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNGA3Q16281 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA3Q16281 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA3Q16281 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA3Q16281 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA3Q16281 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA3Q16281 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA3Q16281 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA3Q16281 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA3Q16281 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA3Q16281 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA3Q16281 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA3Q16281 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA3Q16281 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA3Q16281 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA3Q16281 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA3Q16281 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA3Q16281 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA3Q16281 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA3Q16281 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNGA3Q16281 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA3Q16281 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNGA3Q16281 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA3Q16281 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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