Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2F4Q16254 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms