Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC6Q16204 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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