Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIP11Q15643 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIP11Q15643 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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