Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF1AQ15573 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1AQ15573 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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