Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SURF1Q15526 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
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