Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDSNQ15517 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms