Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKD1Q15139 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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