Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK1Q15118 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK1Q15118 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK1Q15118 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK1Q15118 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK1Q15118 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK1Q15118 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK1Q15118 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK1Q15118 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PDK1Q15118 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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PDK1Q15118 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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PDK1Q15118 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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PDK1Q15118 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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PDK1Q15118 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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PDK1Q15118 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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