Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CIRBPQ14011 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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