Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CKAP5Q14008 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms