Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP1Q13835 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP1Q13835 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms