Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA1SQ13698 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
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