Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PICALMQ13492 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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