Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD4Q13485 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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