Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA4Q13439 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GOLGA4Q13439 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms