Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SF3B2Q13435 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
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