Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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