Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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SCGB2A2Q13296 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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SCGB2A2Q13296 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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SCGB2A2Q13296 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB2A2Q13296 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB2A2Q13296 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB2A2Q13296 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB2A2Q13296 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB2A2Q13296 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB2A2Q13296 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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SCGB2A2Q13296 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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