Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PRDM2Q13029 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PRDM2Q13029 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC36■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms