Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 NSA1YGL111W 1392 nt2.21□□□□□ -2.06
USB1Q12208 PDR1YGL013C 3207 nt2.21□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YLR001CYLR001C 2589 nt2.2□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YJL132WYJL132W 2253 nt2.2□□□□□ -2.06
USB1Q12208 SEN54YPL083C 1404 nt2.2□□□□□ -2.06
USB1Q12208 EDS1YBR033W 2760 nt2.2□□□□□ -2.06
USB1Q12208 VAC14YLR386W 2643 nt2.2□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YDR250CYDR250C 276 nt2.2□□□□□ -2.06
USB1Q12208 SPT15YER148W 723 nt2.2□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.2□□□□□ -2.06
USB1Q12208 ARC19YKL013C 516 nt2.2□□□□□ -2.06
USB1Q12208 BET5YML077W 480 nt2.2□□□□□ -2.06
USB1Q12208 SWA2YDR320C 2007 nt2.2□□□□□ -2.06
USB1Q12208 MRD1YPR112C 2664 nt2.19□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YGL176CYGL176C 1665 nt2.19□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YNL193WYNL193W 1677 nt2.19□□□□□ -2.06
USB1Q12208 AYT1YLL063C 1425 nt2.19□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YJR071WYJR071W 369 nt2.19□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.19□□□□□ -2.06
USB1Q12208 RIF2YLR453C 1188 nt2.19□□□□□ -2.06
USB1Q12208 GAB1YLR459W 1185 nt2.19□□□□□ -2.06
USB1Q12208 ATG16YMR159C 453 nt2.19□□□□□ -2.06
USB1Q12208 MIC27YNL100W 705 nt2.19□□□□□ -2.06
USB1Q12208 DUG3YNL191W 1074 nt2.19□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YOL166CYOL166C 339 nt2.19□□□□□ -2.06
USB1Q12208 MCT1YOR221C 1083 nt2.19□□□□□ -2.06
USB1Q12208 ATG5YPL149W 885 nt2.19□□□□□ -2.06
USB1Q12208 NEL1YHR035W 1893 nt2.19□□□□□ -2.06
USB1Q12208 ANR2YKL047W 1551 nt2.19□□□□□ -2.06
USB1Q12208 PDR11YIL013C 4236 nt2.18□□□□□ -2.06
USB1Q12208 GCD10YNL062C 1437 nt2.18□□□□□ -2.06
USB1Q12208 SPB1YCL054W 2526 nt2.18□□□□□ -2.06
USB1Q12208 POL4YCR014C 1749 nt2.18□□□□□ -2.06
USB1Q12208 ERV1YGR029W 570 nt2.18□□□□□ -2.06
USB1Q12208 MPC3YGR243W 441 nt2.18□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YGR293CYGR293C 462 nt2.18□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt2.18□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YJL169WYJL169W 369 nt2.18□□□□□ -2.06
USB1Q12208 RPA12YJR063W 378 nt2.18□□□□□ -2.06
USB1Q12208 SFT1YKL006C-A 294 nt2.18□□□□□ -2.06
USB1Q12208 COQ10YOL008W 624 nt2.18□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.18□□□□□ -2.06
USB1Q12208 CTP1YBR291C 900 nt2.18□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YPP1YGR198W 2454 nt2.17□□□□□ -2.06
USB1Q12208 ARP8YOR141C 2646 nt2.17□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YGR111WYGR111W 1203 nt2.17□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.17□□□□□ -2.06
USB1Q12208 CWC24YLR323C 780 nt2.17□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YNL171CYNL171C 369 nt2.17□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YOR203WYOR203W 354 nt2.17□□□□□ -2.06
USB1Q12208 RPB8YOR224C 441 nt2.17□□□□□ -2.06
USB1Q12208 ATP3YBR039W 936 nt2.17□□□□□ -2.06
USB1Q12208 AIM4YBR194W 372 nt2.17□□□□□ -2.06
USB1Q12208 PDR3YBL005W 2931 nt2.17□□□□□ -2.06
USB1Q12208 PEX5YDR244W 1839 nt2.17□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YDR336WYDR336W 945 nt2.16□□□□□ -2.06
USB1Q12208 MST27YGL051W 705 nt2.16□□□□□ -2.06
USB1Q12208 FIP1YJR093C 984 nt2.16□□□□□ -2.06
USB1Q12208 MST28YAR033W 705 nt2.16□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YOR050CYOR050C 348 nt2.16□□□□□ -2.06
USB1Q12208 DPB3YBR278W 606 nt2.16□□□□□ -2.06
USB1Q12208 AMS1YGL156W 3252 nt2.16□□□□□ -2.06
USB1Q12208 AGE1YDR524C 1449 nt2.16□□□□□ -2.06
USB1Q12208 UTP6YDR449C 1323 nt2.16□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YNR066CYNR066C 1311 nt2.16□□□□□ -2.06
USB1Q12208 TFB1YDR311W 1929 nt2.15□□□□□ -2.06
USB1Q12208 TRM2YKR056W 1920 nt2.15□□□□□ -2.06
USB1Q12208 BUB1YGR188C 3066 nt2.15□□□□□ -2.06
USB1Q12208 MRP10YDL045W-A 288 nt2.15□□□□□ -2.07
USB1Q12208 AIM6YDL237W 1173 nt2.15□□□□□ -2.07
USB1Q12208 TIM11YDR322C-A 291 nt2.15□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.15□□□□□ -2.07
USB1Q12208 PEX18YHR160C 852 nt2.15□□□□□ -2.07
USB1Q12208 SYS1YJL004C 612 nt2.15□□□□□ -2.07
USB1Q12208 ADI1YMR009W 540 nt2.15□□□□□ -2.07
USB1Q12208 IZH4YOL101C 939 nt2.15□□□□□ -2.07
USB1Q12208 SUL1YBR294W 2580 nt2.14□□□□□ -2.07
USB1Q12208 NEW1YPL226W 3591 nt2.14□□□□□ -2.07
USB1Q12208 BIT61YJL058C 1632 nt2.14□□□□□ -2.07
USB1Q12208 TCA17YEL048C 459 nt2.14□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.14□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.14□□□□□ -2.07
USB1Q12208 SRL1YOR247W 633 nt2.14□□□□□ -2.07
USB1Q12208 AI4Q0065 1671 nt2.13□□□□□ -2.07
USB1Q12208 snR68snR68 136 nt2.13□□□□□ -2.07
USB1Q12208 EMC6YLL014W 327 nt2.13□□□□□ -2.07
USB1Q12208 AIM36YMR157C 768 nt2.13□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YOR055WYOR055W 435 nt2.13□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YLR108CYLR108C 1458 nt2.13□□□□□ -2.07
USB1Q12208 SST2YLR452C 2097 nt2.13□□□□□ -2.07
USB1Q12208 COBQ0105 1158 nt2.12□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt2.12□□□□□ -2.07
USB1Q12208 PPE1YHR075C 1203 nt2.12□□□□□ -2.07
USB1Q12208 GSP1YLR293C 660 nt2.12□□□□□ -2.07
USB1Q12208 ECM13YBL043W 774 nt2.12□□□□□ -2.07
USB1Q12208 KTI11YBL071W-A 249 nt2.12□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YNL276CYNL276C 396 nt2.12□□□□□ -2.07
USB1Q12208 ISU1YPL135W 498 nt2.12□□□□□ -2.07
USB1Q12208 SUT2YPR009W 807 nt2.12□□□□□ -2.07
USB1Q12208 CSF1YLR087C 8877 nt2.12□□□□□ -2.07
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