Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 PPX1YHR201C 1194 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YLR257WYLR257W 966 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 ERG29YMR134W 714 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 CSI2YOL007C 1026 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YRO2YBR054W 1035 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 CUR1YPR158W 759 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 PKH1YDR490C 2301 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 EMP70YLR083C 2004 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YCL020WYCL020W 1317 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 RPA135YPR010C 3612 nt3.17□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 SQS1YNL224C 2304 nt3.16□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 IOC3YFR013W 2364 nt3.16□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 REC8YPR007C 2043 nt3.16□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 EXO5YBR163W 1758 nt3.16□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 KEI1YDR367W 666 nt3.16□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 FMP32YFL046W 624 nt3.16□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 MND1YGL183C 660 nt3.16□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YIP1YGR172C 747 nt3.16□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 PCL5YHR071W 690 nt3.16□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 SRL3YKR091W 741 nt3.16□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 MST28YAR033W 705 nt3.16□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 ADI1YMR009W 540 nt3.16□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YPL142CYPL142C 318 nt3.16□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 AFT2YPL202C 1251 nt3.16□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 MBA1YBR185C 837 nt3.16□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 STN1YDR082W 1485 nt3.16□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 STP2YHR006W 1626 nt3.15□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 DIA2YOR080W 2199 nt3.15□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 YEL025CYEL025C 3567 nt3.15□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 SKO1YNL167C 1944 nt3.15□□□□□ -1.9
NMD4Q12129 NTF2YER009W 378 nt3.15□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 VFA1YER128W 612 nt3.15□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 SNO3YFL060C 669 nt3.15□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YHR054CYHR054C 1065 nt3.15□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 ECI1YLR284C 843 nt3.15□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YMR141CYMR141C 309 nt3.15□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 RPL16BYNL069C 597 nt3.15□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 SNO2YNL334C 669 nt3.15□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 NTC20YBR188C 423 nt3.15□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 DNM1YLL001W 2274 nt3.15□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 ENA5YDR038C 3276 nt3.15□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 ENA2YDR039C 3276 nt3.15□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 ENA1YDR040C 3276 nt3.15□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 POL2YNL262W 6669 nt3.15□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 CIK1YMR198W 1785 nt3.15□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 TFC1YBR123C 1950 nt3.14□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 ARO1YDR127W 4767 nt3.14□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 RPL11BYGR085C 525 nt3.14□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YNL203CYNL203C 612 nt3.14□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 RPL11AYPR102C 525 nt3.14□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 RIX1YHR197W 2292 nt3.14□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 EXO84YBR102C 2262 nt3.14□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YNR063WYNR063W 1824 nt3.14□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YMR018WYMR018W 1545 nt3.14□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 SRB4YER022W 2064 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YCT1YLL055W 1596 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 JJJ2YJL162C 1752 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YCL019WYCL019W 5313 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 PBP4YDL053C 558 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 ECO1YFR027W 846 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 USE1YGL098W 738 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YGL159WYGL159W 1113 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YET1YKL065C 621 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 ATG38YLR211C 681 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 GOT1YMR292W 417 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 GIS2YNL255C 462 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 SWD3YBR175W 948 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 MIT1YEL007W 2001 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 TOM70YNL121C 1854 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 URB2YJR041C 3525 nt3.13□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YTA7YGR270W 4140 nt3.12□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 STI1YOR027W 1770 nt3.12□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 FLO9YAL063C 3969 nt3.12□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 PDS5YMR076C 3834 nt3.12□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 SNA4YDL123W 423 nt3.12□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.12□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 MIC19YFR011C 513 nt3.12□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 REC102YLR329W 795 nt3.12□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YPR147CYPR147C 915 nt3.12□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 SEC66YBR171W 621 nt3.12□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 CDH1YGL003C 1701 nt3.12□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 GCN1YGL195W 8019 nt3.12□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.12□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.12□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.12□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 ASI3YNL008C 2031 nt3.11□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 PUG1YER185W 912 nt3.11□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 MST27YGL051W 705 nt3.11□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 ASG7YJL170C 630 nt3.11□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 RPL17BYJL177W 555 nt3.11□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 PRP21YJL203W 843 nt3.11□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 MRPL38YKL170W 417 nt3.11□□□□□ -1.91
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