Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	TRA1	YHR099W	11235 nt		2.57	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	EAP1	YKL204W	1899 nt		2.56	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	IRC3	YDR332W	2070 nt		2.56	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	TCD1	YHR003C	1290 nt		2.56	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	YNL203C	YNL203C	612 nt		2.56	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	YOR073W-A	YOR073W-A	234 nt		2.56	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	YPL135C-A	YPL135C-A	174 nt		2.56	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	MUS81	YDR386W	1899 nt		2.56	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	RPO41	YFL036W	4056 nt		2.56	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	DPP1	YDR284C	870 nt		2.55	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	YGR293C	YGR293C	462 nt		2.55	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	YIL054W	YIL054W	318 nt		2.55	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	RPL15A	YLR029C	615 nt		2.55	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	MST28	YAR033W	705 nt		2.55	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	YLR198C	YLR198C	360 nt		2.55	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	SUB1	YMR039C	879 nt		2.55	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	UBP15	YMR304W	3693 nt		2.55	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	YOR387C	YOR387C	621 nt		2.55	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	SPT14	YPL175W	1359 nt		2.55	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	YBR201C-A	YBR201C-A	204 nt		2.55	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	SEC26	YDR238C	2922 nt		2.55	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	BNI4	YNL233W	2679 nt		2.55	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	RED1	YLR263W	2484 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	NAB3	YPL190C	2409 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	CDC5	YMR001C	2118 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	ORC2	YBR060C	1863 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	SLP1	YOR154W	1764 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	PSD2	YGR170W	3417 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	21S_rRNA	21S_rRNA	3296 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	MDM10	YAL010C	1482 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	snR78	snR78	87 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	SHR3	YDL212W	633 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	YFL015C	YFL015C	495 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	RIM9	YMR063W	720 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	SRT1	YMR101C	1032 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	YNL043C	YNL043C	321 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	TCB2	YNL087W	3537 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	SIN3	YOL004W	4611 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	RLI1	YDR091C	1827 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	GIN4	YDR507C	3429 nt		2.54	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	YNL011C	YNL011C	1335 nt		2.53	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	ARP8	YOR141C	2646 nt		2.53	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	SRB7	YDR308C	423 nt		2.53	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	HMF1	YER057C	390 nt		2.53	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	SEC4	YFL005W	648 nt		2.53	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	RFA3	YJL173C	369 nt		2.53	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	POL32	YJR043C	1053 nt		2.53	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	RPA12	YJR063W	378 nt		2.53	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	YKL065W-A	YKL065W-A	222 nt		2.53	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	YKL070W	YKL070W	510 nt		2.53	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	RPL6B	YLR448W	531 nt		2.53	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	TSR4	YOL022C	1227 nt		2.53	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	YOL114C	YOL114C	609 nt		2.53	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	POL4	YCR014C	1749 nt		2.53	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	SAK1	YER129W	3429 nt		2.53	□□□□□ -2
VIK1	Q12045	MAK11	YKL021C	1407 nt		2.52	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	TRM82	YDR165W	1335 nt		2.52	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	RIM13	YMR154C	2184 nt		2.52	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	RUB1	YDR139C	234 nt		2.52	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	tF(GAA)D	tF(GAA)D	73 nt		2.52	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	tF(GAA)N	tF(GAA)N	73 nt		2.52	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	RPN9	YDR427W	1182 nt		2.52	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	YGL242C	YGL242C	546 nt		2.52	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	FSH1	YHR049W	732 nt		2.52	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	YIL046W-A	YIL046W-A	165 nt		2.52	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	YIR021W-A	YIR021W-A	213 nt		2.52	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	YML037C	YML037C	1023 nt		2.52	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	SAS2	YMR127C	1017 nt		2.52	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	snR35	snR35	204 nt		2.52	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	KRE33	YNL132W	3171 nt		2.52	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	VHR1	YIL056W	1923 nt		2.52	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	YJL049W	YJL049W	1353 nt		2.51	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	FAR11	YNL127W	2862 nt		2.51	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	GUK1	YDR454C	564 nt		2.51	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	HLR1	YDR528W	1272 nt		2.51	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	MAM1	YER106W	909 nt		2.51	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	COG7	YGL005C	840 nt		2.51	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	ERG20	YJL167W	1059 nt		2.51	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	MRPL38	YKL170W	417 nt		2.51	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	YKR070W	YKR070W	1059 nt		2.51	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	YLR339C	YLR339C	552 nt		2.51	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	ERV41	YML067C	1059 nt		2.51	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	HSP10	YOR020C	321 nt		2.51	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	GCY1	YOR120W	939 nt		2.51	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	ATP3	YBR039W	936 nt		2.51	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	PEX5	YDR244W	1839 nt		2.51	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	MPS1	YDL028C	2295 nt		2.51	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	PHO2	YDL106C	1680 nt		2.5	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	TMA64	YDR117C	1698 nt		2.5	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	SLS1	YLR139C	1932 nt		2.5	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	YDR170W-A	YDR170W-A	1323 nt		2.5	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	YBL005W-A	YBL005W-A	1323 nt		2.5	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	YMR046C	YMR046C	1323 nt		2.5	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	YNL284C-A	YNL284C-A	1323 nt		2.5	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	VPS13	YLL040C	9435 nt		2.5	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	RPL13A	YDL082W	600 nt		2.5	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	YFH7	YFR007W	1062 nt		2.5	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	BAT1	YHR208W	1182 nt		2.5	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	BET3	YKR068C	582 nt		2.5	□□□□□ -2.01
VIK1	Q12045	YLR169W	YLR169W	354 nt		2.5	□□□□□ -2.01

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