Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DDR1Q08345 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms